I 1860 kom det en ny grunnleggende endring i føringen av rullene. Lov om verneplikt og utskriving av 12. oktober 1857 hadde i §10 bestemt at ethvert tinglag samt enhver kjøpstad skulle utgjøre et særskilt loddtrekningsdistrikt, og at det for hvert distrikt skulle føres egen mannskapsrulle (§11). Disse rullene skulle føres ved krigskommissariatene. Rullene hos innrulleringssjefen blir følgelig fra 1860 av rene sjømannsruller. Bergen innrulleringsdistrikt omfattet fra 1860 til 1911 kretsene Stavanger, Skudesnes, Haugesund, Bergen og Florø, med egne ruller for hver enkelt krets. I Statsarkivet i Bergen ligger rullene for Stavanger, Skudesnes og Haugesund fra 1860 opp til begynnelsen av 1870-årene, samt maskinist- og fyrbøterrullen for Stavanger og Haugesund 1883-1890. Sjøfartshovedrullene er kretsvise ruller for sjømenn i utenriksfart som hadde oppnådd graden "halvbefarne" (minst 12 måneder i utenriksfart etter fyllte 15 år). Fra 1883 blir disse rullene delt i to serier, A-serien for matroser, B-serien for maskinister og fyrbøtere. I Sjøfartsannotasjonsrullene skulle man føre mannskaper i utenriksfart som var under den militære utskrivingsalder (22 år), eller ikke hadde oppnådd grad som "halvbefarne". Her skulle også utlendinger føres inn. Fram til 1869 ble det ført egne skipper- og styrmannsruller, seinere er disse ført i de vanlig sjøfartshovedrullene.