Jakobs menighet ble opprettet ifølge kgl.res. 10.07.1874 og trådte i kraft 01.01.1875 ved at nordøstre del av Vår frelsers menighet ble skilt ut. Grensen skulle følge Møllerveien fra Akerselva, Møllergata, Youngs gate, Storgata, Nygata, Vognmannsgata, Rødfyllgata, Tomtegata og Akerselva. 1875-1880 fikk menigheten benytte Vår frelsers kirke hver annen søndag. Jakob kirke ble innviet 08.10.1880 av biskop Essendrop. Ved kgl.res. 28.09.1897 ble menigheten utvidet, og grensene skulle etter det følge Møllerveien, Maridalsveien, Fredensborgveien, Rosteds gate, Møllergata, Youngs gate, Storgata, Brugata, Akerselva, Trondheimsveien, Herslebs gate og Nordre gate. Christian Krohgs gate ble ved kgl.res. 18.11.1899 lagt til Vaterlands småkirkemenighet. Ved kgl.res. 11.02.1938 ble en del av Matteus menighet som begrenses av Trondheimsveien, Kirkegårdsgata, Rathkes gate og Herslebs gate, lagt til Jakobs menighet, og samtidig ble en del av Hauges menighet som begrenses av Akerselva, Sofienberggata, Toftes gate og Nordre gate lagt til Jakobs menighet. Kgl.res. 16.07.1959 nedla småkirkemenigheten i Vaterland fra 01.09.1959 og regulerte - som følge av nedleggelsen - grensene mellom domkirkens, Jakobs og Grønlands menigheter. Jakob menighet ble nedlagt i 1984.