Herøy prestegjeld hadde i 1589 5 kirker og 3 prester. Sokneprestene hadde Herøy, en residerende kapellan hadde Ulstein og Hareid, og en kapellan hadde Sande og Rovde. Fra 1669 til 1747 lå Herøy kall til kapellanen ved Vår Frue kirke i Trondheim. Prestegjeldet ble delt i to; Herøy og Ulstein med Hareid, ved reskript 18.8.1747. Ved senere deling ble Sande skilt ut fra 1.7.1866. Leikanger annekssokn ble opprettet fra 1.1.1873 ved kgl.res. 23.11.1872, og Leikanger kirke ble vigslet 26.1.1873. Ved kgl.res. 12.5.1888 ble gårdene i Eiksundbygda og på Eikøya (Ødegarden, Eiksund, Eiksundvåg, Sundet, Hjellvika, Eika og Havåg - matr.nr. 140-144) fra 1.1.1899 overført fra Rovde sokn i Sande prestegjeld til Leikanger sokn i Herøy prestegjeld. Etter kgl.res.28.10.1911 plikter soknepresten å møte en gang årlig på Rindøy hjelpekirkegård for å forrette jordfesting. Indre Herøy kapell ble bygget på tomt på prestegården etter kgl.res. 17.4.1913. Soknekirken skulle bli flyttet til Vågskaret på Bergsøya når kapellet var ferdig, og der skulle den utvides. Indre Herøy kapell skulle ha 18 gudstjenester årlig.