Balsfjord og Malangen ble utskilt som eget sokn i Tromsø prestegjeld ved kgl.res. 2. februar 1852. Kgl.res. 18. oktober 1856 bestemte at Balsfjord og Malangen skulle bli eget prestegjeld med Balsfjord som hovedsokn. Senere har en del endringer av grensene funnet sted: - Gårdene Kongsli, Elvevoll, Rostad, Sverresvoll, Nordgård og Solvoll ble overført fra Balsfjord sokn til Målselv prestegjeld fra 1. januar 1864 (kgl.res. 15. august 1863). - Gårdene Ytre og Indre Navaren ble overført fra Lenvik prestegjeld til Malangen sokn ved kgl.res. 26. mars 1870. - Gårdene Bentsjord, Brokskar, Nord- og Sør-Mjelde, Løgstad, Kvalsnes og Bakkjord ble overført fra Malangen sokn til Tromsøysund prestegjeld ved kgl.res. 24. februar 1872. - Gården Kilen ble overført fra Lyngen prestegjeld til Balsfjord sokn ved kgl.res. 7. oktober 1874. - Gården Målsnes ble overført fra Målselv prestegjeld til Malangen sokn ved kgl.res. 8. mars 1890.