Johannes menighet ble opprettet 01.01.1875 ifølge kgl. res. 10.07.1874. Området ble utskilt fra Trefoldighets menighet, begrenset av Kongens gate, Karl Johans gate, Drammensveien, Munkedamsveien, Enga og Pipervikbukta. Ved kgl. res. 28.09.1897 ble grensene fastsatt til Festningsterritoriets grense fra Pipervika til Nedre Slottsgate, Karl Johans gate, Drammensveien, Parkveien og Munkedamsveien til sjøen ved Filipstad. Ifølge kgl. res. 13.01.1911 ble Pipervikens småkirkemenighet opprettet i området mellom Ruseløkkveien, Stortingsgata, Rosenkrantz gate og sjøen. Den 12.06.1927 holdtes siste gudstjeneste i Johanneskirken. Pipervikskirken ble benyttet til gudstjenester inntil Johannes menighet ifølge kgl. res. 06.12.1929 ble nedlagt 01.04.1930 og lagt under Vår Frelsers menighet.