Ved forordning 8.2.1671 vart landet inndelt i 4 hovudamt ( stiftamt). Bergenhus stiftamt omfatta futedøma frå Sunnhordland til Nordfjord ( første tida også Sunnmøre) og Bergen by. Det vart administrert av stiftamtmannen. I 1763 vart Nordre Bergenhus amt utskilt som eige med eige amtmann. Stiftamtmannen fortsatt å være m.a. amtmannen over Søndre Bergenhus amt. I tida 1831-1907 var stiftamtmannsembetet og Søndre Bergenhus amt skilde. Deretter vart det administrert under eitt av stiftamtmannen ( til embetet vart avskipa i 1918), og seinare av fylkesmannen i Hordaland. Søndre Bergenhus amt hadde eige kontorhald og eige arkiv fra 1.1.1828. Nokre arkivsaker vart skadd i ein brann i 1921, men dei fleiste arkivrekkjer går attende til 1820-åra, og fram til ca. 1980. Avleveringa frå perioden ca. 1960-1980 er under ordning.