Fiskerisjefen hadde faglig ansvar for de kommunale fiskerirettlederne. Disse tilsammen utgjorde Rettledningstjenesten i fiskerinæringen (RIF). Fra 1981 overtok staten det fulle administrative og budsjettmessige ansvaret for RIF, også de kommunale fiskerirettlederne. I 1998 ble RIF og Fiskeridirektoratets kontrollverk (ytre etat) slått sammen til regionkontorer. . I 2003 ble det etablert et felles mattilsyn for sjømat og landbruksbasert matproduksjon. I den forbindelse ble antallet regionkontor under Fiskeridirektoratet redusert fra 9 til 5. Rettledningstjenesten i fiskerinæringen, forvaltningsetat under Fiskeridirektoratet, utgjør sammen med Kontrollverket direktoratets ytre etat. I 1996 ble de to kontorene slått sammen og har nå felles administrasjon. Tjenesten er organisert i 7 kontorer (regioner) under en regionsdirektør. Arbeidsoppgavene spenner over et vidt felt vedrørende fiske og fangst, ressursforvaltning, konsesjoner og finansiering, merkeregister og kontroll av fartøy, fiskermanntallet, kystsoneplanlegging og det marine miljø. Mange av oppgavene tilligger lokalt plasserte fiskerikontorer.