I november 1944 ble prestearkivet i Måsøy evakuert til domprostboligen i Tromsø. Etter krigen ble arkivet sendt tilbake til Måsøy. I katalogen skilles det mellom arkivet til Måsøy eldre sokneprestembete (1746-1813) og arkivet til Måsøy nyere sokneprestembete (1857-). I den mellomliggende perioden lå Måsøy under Hammerfest prestegjeld (se historikk/biografi arkivskapernr. S-0307).