Arkivet frem til 1955 er ordnet etter den improviserte arkivnøkkel av 1905 hvorav legasjonens utgave er arkivert først i saksregisteret. Det går et skille i arkiveringen i 1923 da legasjonen tok i bruk saksnumre med årstall og et større antall undergrupper fremfor fortløpende saksnumre og samledoss. Noen eldre saker ble overført til det nye systemet. Legasjonen i Stockholm har et sjeldent stort utvalg av registre for gjenfinning av korrespondanse, især for årene 1940-1945.