Arkivet etter Avdelingen for hjemmeflåten dekker i hovedsak perioden 1940-1958, men en del saker går helt tilbake til 1936 og noen helt fram til 1969. Det består av to serier, en alfabetisk emneordnet serie og en oppgjørsserie ordnet alfabetisk etter skip. Arkivet inneholder sentralt og viktig materiale om hjemmeflåten under krigen og erstatningsoppgjøret for den etter krigen.